A gyökérkezelés indoka leggyakrabban gyulladás, amit a szuvasodásból származó baktériumpenetráció okoz. Ilyenkor baktérium kerül a gyökércsatornába és annak falába. A gyökérkezelés során a fogbélüreg (pulpa) tartalmát eltávolítjuk, sterillé tesszük, és olyan anyaggal tömjük be, amely tartós zárást biztosít. Az egy-egy fogra jutó érzékelésünk minimális, ezért a pulpa eltávolítása nem fog hiányérzetet kelteni.